Minecraft: Digging Down tager spillerne med på en fælles mineekspedition dybt under jorden, hvor mørke grotter, skjulte skatte og farlige monstre venter bag hver ny passage. Inspireret af det populære Minecraft-univers arbejder spillerne sammen om at udforske hulesystemer, samle ressourcer og gennemføre missioner, mens de hele tiden forsøger at holde liv i deres begrænsede forsyning af fakler. Jo længere ned man bevæger sig i grotten, desto større bliver risikoen, og desto farligere bliver væsnerne, der gemmer sig i mørket.